# 遗传学知识回顾 (genetics)
# 基本概念
- 染色体，chromosome，由一个长链 DNA 分子和被称为组蛋白 (histone) 的蛋白质构成
- DNA，脱氧核糖核酸，由核苷酸构成的双链分子
- 基因，gene，具有遗传效应（编码蛋白质）的 DNA 或 RNA 片段，每个 DNA 分子包含许多个基因
- 基因包含编码区和非编码区，启动子位于非编码区
- 编码区又分为外显子和内含子，内含子又是非编码序列（有待考证）
- 基因组，genome，指包含在该生物的 DNA（部分病毒是 RNA）中的全部遗传信息，即其完整的 DNA 序列，包括基因和非编码 DNA
- 顺式作用原件，cis-regulatory element，位于基因的旁侧，是可以调控其旁侧基因表达的非编码 DNA 序列，包括启动子 (promoter)、增强子、应答元件等；
- 通过与转录因子 (transcription factor) 结合来调控基因；
- cis 表示 "on this side"，即和被调控的基因在同一个 DNA 分子上
- 增强子，enhancer，increase the likelihood that transcription of a particular gene will occur
- 反式作用原件，trans-regulatory element，是可以调控别的基因表达的基因
- 更具体一点，就是编码转录因子的基因
- cis-regulatory 有时也叫 cis-acting，cis-regulation；trans-regulatory 同样
- in vivo，in the living，在活体内（进行于活体内的实验）
- in vitro，in the glass，在玻璃里（进行于试管内 / 活体外的实验）
- ChIP-seq，chromatin immunoprecipitation (ChIP) + massively parallel DNA sequencing TODO
中心法则：DNA 制造 RNA，RNA 制造蛋白质，蛋白质反过来协助前两项流程，并协助 DNA 自我复制
- DNA → RNA，转录 (transcription)
- RNA → 蛋白质，翻译 (translation)
- DNA → DNA，DNA 复制
# 转录 (Transcription)
- 转录因子，transcription factor，是指能够结合在某基因上游特异核苷酸序列（如启动子，增强子）上的蛋白质，这些蛋白质能调控该基因的转录
- 真核生物的 RNA 可以进一步被处理，可能包括聚腺苷酸化，端帽和剪接
# 可变剪接 (Alternative Splicing)
During the process of pre-mRNA → mature mRNA
Particular exons of a gene may be included or excluded under particular conditions (e.g. in particular tissues)
There are numerous modes of alternative splicing observed, of which the most common is exon skipping
# More
Gene expression and regulation - Khan Academy (opens new window)